中国,印第安纳琼斯博士(Harrison Ford饰)与上海黑帮老大交易,对方在换得努尔哈赤的骨灰后便背信弃义,欲灭琼斯之口。关键时刻,机灵小鬼豆丁(Jonathan Ke Quan饰)救下琼斯博士和无故卷进的一位歌女威莉(Kate Capshaw饰)。由于三人乘坐的飞机失事,跳机后,乘着橡皮艇,他们竟漂流到了印度的一个村子。这里河水干涸,庄稼尽毁,饥荒横行,民不聊生。当地人将之归咎为彭高皇宫的妖孽作怪,并将“从天而降”的琼斯一行视为神灵的化身,他们请求琼斯帮他们拿回被掳走的圣石和所有的小孩子。魔宫果然充满古怪,统治者是个小屁孩,贵族们吃水蛭、巨蟒、甲虫、猴脑,皇宫内部更是机关重重,误打误撞..
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